| 国土交通省 | 59213 | 8438.7億円 |
| 環境省 | 9491 | 7167.8億円 |
| 厚生労働省 | 22430 | 6024.0億円 |
| 国税庁 | 11987 | 3928.7億円 |
| 総務省 | 7258 | 3460.8億円 |
| 財務省 | 16683 | 2894.2億円 |
| 経済産業省 | 5454 | 2599.0億円 |
| 法務省 | 13765 | 2287.5億円 |
| 内閣府 | 5462 | 1796.7億円 |
| 日本郵政公社を承継した機関 | 7586 | 1304.1億円 |
| 全国健康保険協会 | 867 | 1040.8億円 |
| 海上保安庁 | 6503 | 781.7億円 |
| デジタル庁 | 1525 | 737.9億円 |
| 内閣官房 | 1090 | 608.3億円 |
| 最高裁判所 | 2539 | 605.3億円 |
| 国立研究開発法人産業技術総合研究所 | 2664 | 541.4億円 |
| 防衛省 | 9642 | 537.6億円 |
| 日本年金機構 | 2089 | 530.2億円 |
| 外務省 | 2399 | 478.0億円 |
| 国家公安委員会（警察庁） | 2165 | 396.1億円 |
| 文部科学省 | 1529 | 323.2億円 |
| 警察庁 | 1487 | 320.0億円 |
| 気象庁 | 1735 | 286.5億円 |
| 国立大学法人 | 25220 | 243.2億円 |
| 農林水産省 | 5594 | 227.0億円 |
| 特許庁 | 317 | 191.7億円 |
| 検察庁 | 2660 | 189.9億円 |
| 日本放送協会 | 4249 | 150.2億円 |
| 株式会社日本政策金融公庫 | 1408 | 133.0億円 |
| 金融庁 | 776 | 105.7億円 |
| 衆議院 | 963 | 100.3億円 |
| 国立研究開発法人情報通信研究機構 | 1686 | 79.9億円 |
| 林野庁 | 2144 | 76.4億円 |
| 国立研究開発法人理化学研究所 | 2795 | 73.0億円 |
| 内閣 | 310 | 70.6億円 |
| 宮内庁 | 621 | 70.3億円 |
| 会計検査院 | 484 | 65.9億円 |
| 独立行政法人都市再生機構 | 2305 | 64.0億円 |
| 大学共同利用機関法人 | 1772 | 59.2億円 |
| 文化庁 | 431 | 58.4億円 |
| 国立研究開発法人日本原子力研究開発機構 | 2232 | 56.7億円 |
| 日本中央競馬会 | 3160 | 49.5億円 |
| こども家庭庁 | 288 | 48.4億円 |
| 東京地下鉄株式会社 | 623 | 48.0億円 |
| 独立行政法人国立病院機構 | 12900 | 42.5億円 |
| 国立研究開発法人国立環境研究所 | 362 | 34.0億円 |
| 人事院 | 148 | 32.2億円 |
| 参議院 | 249 | 30.0億円 |
| 消費者庁 | 332 | 29.8億円 |
| 独立行政法人国際協力機構 | 334 | 27.6億円 |
| 株式会社国際協力銀行 | 439 | 25.0億円 |
| 独立行政法人宇宙航空研究開発機構 | 555 | 22.6億円 |
| 独立行政法人日本学生支援機構 | 380 | 21.5億円 |
| 東日本高速道路株式会社 | 1235 | 21.4億円 |
| 国立研究開発法人防災科学技術研究所 | 363 | 21.2億円 |
| 日本私立学校振興・共済事業団 | 674 | 20.3億円 |
| 国立研究開発法人科学技術振興機構 | 541 | 20.0億円 |
| 独立行政法人国立印刷局 | 1045 | 19.4億円 |
| 成田国際空港株式会社 | 161 | 19.0億円 |
| 独立行政法人高齢・障害・求職者雇用支援機構 | 967 | 18.6億円 |
| 公正取引委員会 | 276 | 18.6億円 |
| 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構 | 547 | 18.1億円 |
| 株式会社日本政策投資銀行 | 1341 | 18.0億円 |
| 中日本高速道路株式会社 | 1274 | 18.0億円 |
| 独立行政法人福祉医療機構 | 162 | 17.7億円 |
| 国立研究開発法人物質・材料研究機構 | 676 | 17.2億円 |
| 年金積立金管理運用独立行政法人 | 95 | 16.4億円 |
| 原子力安全庁 | 70 | 15.8億円 |
| 独立行政法人国民生活センター | 96 | 14.0億円 |
| 消防庁 | 74 | 13.6億円 |
| 内閣法制局 | 37 | 10.9億円 |
| 国立研究開発法人国立循環器病研究センター | 280 | 10.7億円 |
| 国立研究開発法人量子科学技術研究開発機構 | 1238 | 10.5億円 |
| 国立研究開発法人国立がん研究センター | 711 | 9.54億円 |
| 独立行政法人日本スポーツ振興センター | 267 | 9.52億円 |
| 独立行政法人水資源機構 | 249 | 8.53億円 |
| 国立研究開発法人新エネルギー・産業技術総合開発機構 | 131 | 8.32億円 |
| 独立行政法人造幣局 | 612 | 7.86億円 |
| 独立行政法人国立高等専門学校機構 | 1193 | 5.36億円 |
| 独立行政法人住宅金融支援機構 | 380 | 4.83億円 |
| 国立研究開発法人水産研究・教育機構 | 596 | 4.78億円 |
| 独立行政法人統計センター | 100 | 4.77億円 |
| 国立研究開発法人海上・港湾・航空技術研究所 | 107 | 4.25億円 |
| 独立行政法人農業者年金基金 | 62 | 4.11億円 |
| 独立行政法人自動車技術総合機構 | 297 | 4.05億円 |
| 独立行政法人鉄道建設・運輸施設整備支援機構 | 474 | 3.86億円 |
| 独立行政法人勤労者退職金共済機構 | 204 | 3.82億円 |
| 西日本高速道路株式会社 | 1396 | 3.27億円 |
| 沖縄振興開発金融公庫 | 117 | 3.03億円 |
| （旧）株式会社商工組合中央金庫（現在は対象外） | 454 | 2.99億円 |
| 国立健康危機管理研究機構 | 130 | 2.99億円 |
| 独立行政法人海技教育機構 | 300 | 2.80億円 |
| 独立行政法人農畜産業振興機構 | 82 | 2.49億円 |
| 独立行政法人大学入試センター | 99 | 2.04億円 |
| 独立行政法人国立文化財機構 | 250 | 1.95億円 |
| 独立行政法人エネルギー・金属鉱物資源機構 | 211 | 1.94億円 |
| 中央労働委員会 | 42 | 1.88億円 |
| 独立行政法人国立公文書館 | 16 | 1.88億円 |
| 独立行政法人労働者健康安全機構 | 1685 | 1.74億円 |
| 独立行政法人労働政策研究・研修機構 | 18 | 1.63億円 |
| 独立行政法人日本芸術文化振興会 | 88 | 1.61億円 |
| 国立研究開発法人国立成育医療研究センター | 444 | 1.57億円 |
| 地方公共団体金融機構 | 108 | 1.54億円 |
| 運輸安全委員会 | 41 | 1.42億円 |
| 独立行政法人日本貿易振興機構 | 196 | 1.18億円 |
| カジノ管理委員会 | 44 | 1.17億円 |
| 個人情報保護委員会 | 77 | 1.09億円 |
| 中間貯蔵・環境安全事業株式会社 | 218 | 0.88億円 |
| 公安調査庁 | 41 | 0.88億円 |
| 国立研究開発法人国際農林水産業研究センター | 27 | 0.88億円 |
| 独立行政法人大学改革支援・学位授与機構 | 47 | 0.82億円 |
| 国立研究開発法人森林研究・整備機構 | 163 | 0.81億円 |
| 公害等調整委員会 | 26 | 0.80億円 |
| 独立行政法人経済産業研究所 | 18 | 0.76億円 |
| 独立行政法人農林水産消費安全技術センター | 48 | 0.71億円 |
| 放送大学学園 | 154 | 0.49億円 |
| 首都高速道路株式会社 | 262 | 0.45億円 |
| 独立行政法人日本高速道路保有・債務返済機構 | 35 | 0.44億円 |
| 国立研究開発法人土木研究所 | 178 | 0.31億円 |
| 阪神高速道路株式会社 | 303 | 0.28億円 |
| 地方競馬全国協会 | 50 | 0.28億円 |
| 独立行政法人航空大学校 | 30 | 0.24億円 |
| 独立行政法人国際交流基金 | 127 | 0.22億円 |
| 国立研究開発法人国立長寿医療研究センター | 79 | 0.20億円 |
| 独立行政法人家畜改良センター | 183 | 0.20億円 |
| 独立行政法人国立美術館 | 248 | 0.18億円 |
| 独立行政法人製品評価技術基盤機構 | 159 | 0.15億円 |
| 観光庁 | 1 | 0.14億円 |
| 独立行政法人地域医療機能推進機構 | 1783 | — |
| NTT東日本株式会社 | 303 | — |
| 東京都 | 217 | — |
| （旧）国立研究開発法人国立国際医療研究センター（現在は対象外） | 145 | — |
| 社会保険診療報酬支払基金 | 144 | — |
| 本州四国連絡高速道路株式会社 | 142 | — |
| 独立行政法人中小企業基盤整備機構 | 136 | — |
| 独立行政法人国立青少年教育振興機構 | 131 | — |
| 独立行政法人医薬品医療機器総合機構 | 115 | — |
| 自転車競技法に従い競輪振興法人として指定された法人 | 109 | — |
| 株式会社日本貿易保険 | 104 | — |
| 独立行政法人情報処理推進機構 | 104 | — |
| 国立研究開発法人国立精神・神経医療研究センター | 98 | — |
| 独立行政法人国立科学博物館 | 91 | — |
| 北海道旅客鉄道株式会社 | 84 | — |
| 日本貨物鉄道株式会社 | 69 | — |
| 独立行政法人自動車事故対策機構 | 65 | — |
| 独立行政法人日本学術振興会 | 55 | — |
| 独立行政法人工業所有権情報・研修館 | 49 | — |
| 国立研究開発法人建築研究所 | 41 | — |
| 独立行政法人環境再生保全機構 | 39 | — |
| 独立行政法人駐留軍等労働者労務管理機構 | 39 | — |
| 独立行政法人酒類総合研究所 | 37 | — |
| 千葉県 | 30 | — |
| 北海道 | 26 | — |
| 神奈川県 | 25 | — |
| 復興庁 | 23 | — |
| 独立行政法人教職員支援機構 | 23 | — |
| （旧）独立行政法人国立女性教育会館（現在は対象外） | 22 | — |
| 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所 | 21 | — |
| 農林漁業団体職員共済組合 | 20 | — |
| 地方独立行政法人東京都立病院機構 | 20 | — |
| NTT株式会社 | 19 | — |
| 日本財団 | 18 | — |
| NTT西日本株式会社 | 16 | — |
| 独立行政法人国立特別支援教育総合研究所 | 16 | — |
| 独立行政法人北方領土問題対策協会 | 15 | — |
| 長野県 | 15 | — |
| 大阪府 | 15 | — |
| 独立行政法人国際観光振興機構 | 14 | — |
| 独立行政法人国立重度知的障害者総合施設のぞみの園 | 13 | — |
| 長崎県 | 13 | — |
| 独立行政法人農林漁業信用基金 | 12 | — |
| 岩手県 | 10 | — |
| 兵庫県 | 10 | — |
| 宮城県 | 10 | — |
| 川崎市 | 10 | — |
| 札幌市 | 10 | — |
| 埼玉県 | 9 | — |
| 愛知県 | 9 | — |
| 大阪市 | 9 | — |
| 日本たばこ産業株式会社 | 8 | — |
| 石川県 | 8 | — |
| 小型自動車競走法に従い小型自動車競走振興法人として指定された法人 | 7 | — |
| 群馬県 | 7 | — |
| 京都市 | 7 | — |
| 神戸市 | 7 | — |
| 名古屋市 | 7 | — |
| 静岡県 | 6 | — |
| 福島県 | 6 | — |
| 横浜市 | 6 | — |
| 山形県 | 6 | — |
| 北九州市 | 6 | — |
| （旧）日本郵政公社（現在は対象外） | 5 | — |
| 浜松市 | 5 | — |
| 福井県 | 5 | — |
| 新潟県 | 5 | — |
| 茨城県 | 5 | — |
| 四国旅客鉄道株式会社 | 4 | — |
| 岐阜県 | 4 | — |
| 青森県 | 4 | — |
| 岡山県 | 4 | — |
| 沖縄県 | 4 | — |
| 広島県 | 4 | — |
| 富山県 | 4 | — |
| 熊本県 | 3 | — |
| 公立大学法人首都大学東京 | 3 | — |
| 熊本市 | 3 | — |
| 新潟市 | 3 | — |
| 地方独立行政法人神戸市民病院機構 | 3 | — |
| 福岡県 | 3 | — |
| 大分県 | 3 | — |
| 佐賀県 | 3 | — |
| 京都府 | 3 | — |
| さいたま市 | 3 | — |
| 地方独立行政法人大阪市民病院機構 | 3 | — |
| 公立大学法人名古屋市立大学 | 3 | — |
| 公立大学法人奈良県立医科大学 | 3 | — |
| 滋賀県 | 3 | — |
| 仙台市 | 3 | — |
| 高知県 | 3 | — |
| 千葉市 | 3 | — |
| 高知県公立大学法人 | 2 | — |
| 徳島県 | 2 | — |
| 秋田県 | 2 | — |
| 和歌山県 | 2 | — |
| 三重県 | 2 | — |
| 福岡市 | 2 | — |
| 公立大学法人横浜市立大学 | 2 | — |
| 愛媛県 | 2 | — |
| 堺市 | 2 | — |
| 鳥取県 | 2 | — |
| 地方独立行政法人神奈川県立病院機構 | 2 | — |
| 島根県 | 1 | — |
| 広島市 | 1 | — |
| 京都府公立大学法人 | 1 | — |
| 地方独立行政法人長野県立病院機構 | 1 | — |
| 地方独立行政法人佐賀県医療センター好生館 | 1 | — |
| 静岡市 | 1 | — |
| 公立大学法人秋田県立大学 | 1 | — |
| 奈良県 | 1 | — |
| 地方独立行政法人広島県立病院機構 | 1 | — |
| 公立大学法人富山県立大学 | 1 | — |
| 地方独立行政法人埼玉県立病院機構 | 1 | — |
| 鹿児島県 | 1 | — |
| 栃木県 | 1 | — |
| 地方独立行政法人山口県産業技術センター | 1 | — |
| 公立大学法人福島県立医科大学 | 1 | — |
| 宮崎県 | 1 | — |
| 公立大学法人埼玉県立大学 | 1 | — |
| 地方独立行政法人京都市産業技術研究所 | 1 | — |
| 香川県 | 1 | — |
| 公立大学法人札幌市立大学 | 1 | — |
| 地方独立行政法人大阪府立環境農林水産総合研究所 | 1 | — |
| 独立行政法人男女共同参画機構 | 1 | — |